由于炎症性肠病可累积全消化道，因此会严重影响患者营养的吸收，造成患者身体的消瘦，而对于处于发育期的青少年，错过了发育期,即使治愈后也无法再生长。

　　溃疡性结肠炎10年后出现大肠癌的并发症可能性较高,而克罗恩病诱发癌症的可能性较低,但克罗恩病会导致肠道梗阻严重,诱发瘘,复发率较高。因此患者需要规范治疗的同时,还应定期复查,一般病人需要隔1-2年复查一次。

　　由于炎症性肠病不是高发病且是慢性疾病,因此一般需要一年半到三年的时间才能确诊并采取合理的治疗,一定程度上加大了治疗的难度。例如患有克罗恩病的病人可能被误诊为阑尾炎,因此患者如有反复的腹痛、腹泻甚至拉血便等症状,医院的专科进行及时规范诊治。